Центр инноваций социальной сферы в Ставропольском крае существует как структурное подразделение Фонда поддержки предпринимательства Ставропольского края. Учредителем и координатором центра выступает Министерство экономического развития Ставропольского края. В рамках ЦИСС работает Школа социального предпринимательства. Также на базе ЦИСС работает «пул консультантов», отвечающих за бесплатное комплексное обслуживание 50 социально ориентированных предприятий.